Według Dekretu o Formacji Kapłańskiej „kształcenie naukowe powinno mieć na celu nie samo tylko przekazywanie wiedzy, lecz prawdziwe wewnętrzne wyrobienie alumnów. […] Ze szczególną troską należy zadbać o jedność i gruntowność całego wykształcenia” (por. DFK 17). „Samym sposobem nauczania należy wzbudzić u alumnów umiłowanie konsekwentnego poszukiwania prawdy, zachowywania jej i dowodzenia, przy równoczesnym uczciwym uznawaniu granic ludzkiego poznania” (por. DFK 15).

 

 

Trzonem formacji intelektualnej w sandomierskim seminarium jest 6–letni kurs filozoficzno-teologiczny. Wyższe Seminarium Duchowne w Sandomierzu jest afiliowane do Katolickiego Uniwersytetu Lubelskiego Jana Pawła II w Lublinie. Zwieńczeniem studiów jest osiągnięcie tytułu magistra teologii.

Formacja intelektualna alumnów jest urozmaicona poprzez udział alumnów w sympozjach i spotkaniach naukowych oraz warsztatach ćwiczeniowych.